Aufgrund der am Bodensee während des Winterhalbjahres häufig anzutreffenden Nebellagen wurde der technische Standard in Friedrichshafen stetig erhöht, um einen planmäßigen Flugbetrieb auch bei schlechten Sichtverhältnissen zu ermöglichen. Dazu musste die bestehende Pisten- und Rollwegbefeuerung um eine Aufsetzzonen- und Rollwegmittellinienbefeuerung erweitert werden. Mit diesen ca. 600 Unterflurlampen sind nun insgesamt etwa 1.300 Lampen für die Markierung der Flugbetriebsflächen installiert. Die hohe Präzision des Instrumentenlandesystems (ILS) ermöglicht Starts und Landungen bei Pistensichtweiten von unter 100 Metern (CAT IIIb). Dafür ist jedoch auch eine entsprechende Ausrüstung des Flugzeuges und eine Lizenzierung der Besatzung notwendig.

Selbstverständlich wird auch der Flora und Fauna um und am Flughafen große Beachtung geschenkt. Aus diesem Grund hat sich der Flughafen Friedrichshafen auf den beschwerlichen Weg zur Zertifizierung nach der "EG-Öko-Audit-Verordnung" gemacht. So wird beispielsweise das Oberflächenwasser der gesamten befestigten Betriebsflächen inklusive Piste und Rollwege gesammelt und getrennt weitergeleitet. Flughäfen sind gerne besuchte Erholungs- und Ruhezonen für durchreisende Zugvögel. Um eine mögliche Gefahr für den Luftverkehr trotzdem auszuschließen, werden die Grünflächen intelligent genutzt, um unmittelbar an der Piste wenig interessantes Terrain für Vögel zu bieten. Dafür stehen diese Bereiche in den Randzonen des Geländes zur Verfügung.

Die Piste des Flughafens wurde 1994 von Grund auf saniert und mit einem besonders griffigen Belag versehen (Anti-Skid), um sowohl den Bremsweg als auch den Verschleiß von Bremsen und Reifen auf ein Minimum zu reduzieren.

Mit dieser sowohl technischen als auch navigatorischen Ausstattung muss der Flughafen Friedrichshafen den Vergleich mit größeren Flughäfen nicht scheuen.